Должна ли мастерская по изготовлению печатей иметь лицензию на этот вид деятельности?

Нет, лицензия на изготовление печатей сейчас не требуется. В Федеральном законе от 08.08.2001 №128-ФЗ "О лицензировании отдельных видов деятельности" в Статье 17 в перечне видов деятельности, на осуществление которых требуются лицензии, изготовление печатей и штампов не указано.

Исключение составляют печати с изображением Государственного герба РФ, на которые распространяются требования ГОСТ Р 51511-2001(вступил в силу 01.01.2004 г.) В соответствии с этим документом, гербовые печати можно изготавливать только из резины, и только предприятиям прошедшим добровольную сертификацию (Система сертификации "ПечатьСерт", "Полиграфсерт" и др.).